Charlotta Zetterström är anställd som adjungerad professor vid Institutionen för klinisk neurovetenskap, Sektionen för ögon och syn, Karolinska Institutet sedan den första december 2005.

Charlotta utövar sin dagliga gärning vid S:t Eriks Ögonsjukhus i Stockholm. Hennes kliniska intresse rör sjukdomar i ögats främre segment, främst katarakt hos barn.